Zakład Biochemii Fizycznej

Liczba godzin: 12 godzin konwersatorium
Punkty ECTS: 1
Semestr: zimowy
Dla kogo: kurs przeznaczony przede wszystkim dla studentów kierunku Biochemia (studia II stopnia) jako zajęcia uzupełniająca do kursu Biochemia fizyczna – kurs zaawansowany (WBT-BT341).
Warunki uczestnictwa: brak
Koordynator kursu: dr Agnieszka Polit
Prowadzący konwersatoria:
dr Piotr Bonarek, dr Andrzej Górecki, dr Agnieszka Polit
Godzina i miejsce konwersatoriów:
poniedziałek, godzina 12:00-13:30, sala D106

Tematyka kursu
Zajęcia konwersatoryjne: Struktura makrocząsteczek i techniki służące do jej poznawania na różnym poziomie organizacji. Spektroskopia absorpcyjna i fluorescencyjna. Stacjonarne i rozdzielcze w czasie metody spektroskopii fluorescencyjnej stosowane w badaniach makrocząsteczek, ze szczególnym uwzględnieniem rezonansowego przeniesienia energii wzbudzenia na odległość oraz anizotropii fluorescencji. Czynniki wpływające na stabilność strukturalną makrocząsteczek w roztworze. Procesy denaturacji białek. Denaturacja termiczna i chemiczna. Opis oddziaływania makromolekuł z ligandami w stanie równowagi: parametry termodynamiczne, stechiometria, kooperatywność (modele MWC, KNF). Kinetyka oddziaływania makromolekuł z ligandami: parametry kinetyczne, równania kinetyczne. Techniki ciągłego i zatrzymanego przepływu, techniki relaksacyjne.

Konwersatorium nr 1
Termin: 09.10.2017
Temat: Struktura białek i czynniki wpływające na ich stabilność strukturalną w roztworze. Procesy denaturacji białek.
Prowadzący: dr Piotr Bonarek

Konwersatorium nr 2
Termin: 16.10.2017
Temat: Denaturacja termiczna i chemiczna białek – opis termodynamiczny.
Prowadzący: dr Piotr Bonarek

Konwersatorium nr 3
Termin: 23.10.2017
Temat: Techniki służące do poznawania struktury białek na różnym poziomie jej organizacji. Spektroskopia absorpcyjna i fluorescencyjna.
Prowadzący: dr Agnieszka Polit

Konwersatorium nr 4
Termin: 30.10.2017
Temat: Stacjonarne i rozdzielcze w czasie metody spektroskopii fluorescencyjnej stosowane w badaniach makrocząsteczek, ze szczególnym uwzględnieniem rezonansowego przeniesienia energii wzbudzenia na odległość oraz anizotropii fluorescencji.
Prowadzący: dr Agnieszka Polit

Konwersatorium nr 5
Termin: 06.11.2017
Temat:  Opis oddziaływania makromolekuł z ligandami w stanie równowagi: parametry termodynamiczne, stechiometria, kooperatywność (modele MWC, KNF).
Prowadzący: dr Andrzej Górecki

Konwersatorium nr 6
Termin: 13.11.2017
Temat: Kinetyka oddziaływania makromolekuł z ligandami: parametry kinetyczne, równania kinetyczne. Techniki ciągłego i zatrzymanego przepływu, techniki relaksacyjne.
Prowadzący: dr Andrzej Górecki

1. W trakcie trwania kursu dopuszcza się 1 usprawiedliwioną nieobecność.
2. Spóźnienie większe niż 15 minut daje prowadzącemu prawo nie wpuszczenia studenta na zajęcia.
3. Studentów obowiązuje merytoryczne przygotowanie do zajęć w oparciu o literaturę wskazaną przez prowadzącego.
4. Po zakończeniu każdych zajęć przeprowadzony zostanie test sprawdzający wiedzę i zrozumienie omawianych zagadnień.
5. Warunkiem uzyskania zaliczenia jest obecność na wymaganej ilości zajęć, uczestnictwo w dyskusji oraz uzyskanie pozytywnej oceny z testów.

1. D. Sheehan „Physical Biochemistry", Wiley-Blackwell
2. C. Cantor, P. Schimel „Biophysical chemistry", W. H. Freeman and Company
3. J. R. Lakowicz „Principles in fluorescence spectroscopy", Kluwer Academic Publisher
4. P. Atkins „Chemia fizyczna", PWN